实验九 DNA 的提取和分析(四)
DNA的琼脂糖凝胶电泳
目的和要求
掌握DNA的琼脂糖凝胶电泳法。
实验原理
DNA分子在碱性环境中 带负电荷,在电场中向正极移动。不同的DNA分子由于其电荷、分子量以及构象不同,电泳时有不同的迁移率,所以可通过凝胶电泳使其分离。在紫外灯下,凝胶中的DNA可与溴化乙锭(EB)结合,显示为红色荧光条带。
琼脂糖凝胶电泳所需DNA样品量仅为 。溴化乙锭检测DNA灵敏度很高, 核酸样品即可检出。
DNA在凝胶中的迁移率与分子大小的对数成反比。将未知DNA样品与DNAMarker相比较,可知DNA片段的大小。质粒DNA具有共价闭环DNA(cccDNA)、线形DNA和开环的双连环状DNA(opDNA)3种形式。在电场中,超螺旋DNA比线形和开环DNA泳动快。在制备的质粒中,通常存在超螺旋和开环DNA,因此可显示出2条电泳条带。
实验试剂和器材
(一)试剂:
1.DNA样品:细菌染色体DNA、PCR产物等。
标准DNAMarker
TAE缓冲液 (pH8.0):每升溶液中含有 Tris, 冰乙酸, EDTA。电泳时稀释成 浓度使用。
4.6×loadingbuffer(溴酚兰-甘油指示剂):含 溴酚蓝, 甘油。
- 溴化乙啶染液: 称取 溴化乙啶, 用重蒸水溶解定容到 , 取 此溶液用 TAE缓冲液稀释到 , 最终浓度为 。
(二)器材
离心管,电泳槽,电泳仪,移液枪,紫外成像仪。
实验方法
制胶:称取琼脂糖粉末,置于三角瓶中,加入 TAE 缓冲液配成 或 的浓度,加热使琼脂糖全部融化于缓冲液中,待溶液温度降至 时,立即倒入制胶槽中,插入样品梳。在室温放置 h,待凝胶全部凝结后,轻轻拔出样品梳。然后在电泳槽中加入电泳缓冲液直到没过凝胶为止。
加样:取适量 DNA 样品,按比例加入 loading buffer,混匀后小心地加到样品槽中。同时,在另一个样品槽中加入适量 DNA 标准物(DNA Marker),在同一块凝胶板上进行电泳。
电泳:维持恒压 ,电泳 ,直到溴酚兰指示剂移动到凝胶底部,停止电泳。
染色:将凝胶取出后浸入 溴化乙啶溶液中,染色 。染液可反复多次使用。
观察:将凝胶板置于 波长紫外灯下进行观察。DNA存在的位置呈现橙黄色荧光。
注意事项
溴乙啶有毒,配制和使用溶液时要戴手套,勿将溶液滴洒在台面或地面上。溴乙啶溶液于室温保存在棕色瓶中。
倒凝胶板时不要太厚,否则影响电泳效果。
思考题
- 根据本实验结果,能否确定细菌 DNA 的分子量,为什么?
- 溴化乙啶有毒,它的作用机理是什么?
危害与防护
实验室安全风险评估与防护指南
免责声明: 本指南由AI生成,仅供参考。所有实验操作必须在合格人员的监督下,并严格遵守您所在机构的具体安全规章制度(SOP)。在开始实验前,请务必查阅并理解所有化学品的安全技术说明书(SDS)。
1. 化学品危害分析
- 溴化乙锭 (Ethidium Bromide):
- GHS危险性: GHS06 (急性毒性), GHS08 (健康危害)
- 主要暴露途径: [吸入]、[皮肤接触]、[食入]
- 靶器官: 中枢神经系统、周围神经系统
- 急性接触症状: 咳嗽、咽喉疼痛、眼部红肿、震颤、虚脱和镇静
- 毒性数据:
- 小鼠腹腔注射LD50: 20 mg/kg
- 小鼠皮下注射LD50: 110 mg/kg
- 大鼠静脉注射LD50: 27 mg/kg
- 作用机理: 溴化乙锭是DNA嵌入剂,能插入DNA双螺旋结构,导致DNA结构改变和突变
2. 关键操作风险预警 (按实验步骤)
步骤: 配制0.5μg/mL溴化乙锭染液
- 风险剖析: 称量5mg溴化乙锭粉末时,极易产生粉尘和气溶胶,将固体的毒性和诱变性风险转化为吸入中毒风险
- 核心风险: 吸入中毒 与 诱变暴露风险
步骤: 染色操作 - 将凝胶浸入溴化乙锭溶液中
- 风险剖析: 倾倒和转移溴化乙锭溶液时存在滴溅风险,可能导致化学品与皮肤或眼睛直接接触
- 核心风险: 化学灼伤 与 直接皮肤接触
3. 综合安全防护措施
个人防护装备 (PPE):
- 手部防护: 必须佩戴双层丁腈手套
- 眼部防护: 必须佩戴化学安全护目镜
- 呼吸防护: 在通风橱内操作,如必须在普通环境下操作,需佩戴N95口罩
- 身体防护: 标准实验服,如有大量液体操作需求,建议加穿防化围裙
工程控制:
- 溴化乙锭染液的配制和使用必须在化学通风橱内进行
- 确保实验室有良好的一般通风
4. 安全操作规程
始终在通风橱内操作溴化乙锭粉末和溶液
缓慢倾倒溴化乙锭溶液,避免溅出
操作时穿戴完整PPE,切勿徒手接触任何可能沾染溴化乙锭的器具
废物处理:
- 溴化乙锭废液需专门收集,按照有毒化学废物处理
被溴化乙锭污染的枪头、离心管等均作为危险废物处理
5. 应急处理预案
- 皮肤接触: 立即脱去污染衣物,用大量清水冲洗至少15分钟
- 眼睛接触: 立即用洗眼器冲洗至少15分钟,寻求医疗救助
- 小型泄漏: 佩戴适当PPE,用吸附材料(如活性炭、沙子)覆盖吸收
- 废弃处理: 污染的凝胶、枪头等必须作为危险废物专门处理
安全警示: 溴化乙锭是已知的强诱变剂,必须采取严格防护措施避免任何形式的人体接触。